La Classe ToolStripComboBox ne gère pas l'évenement MouseWheel

Mais si.
Si défilement il y a c'est dans le ComboBox, car comme tu le sais ce ToolStripComboBox est construit autour d'un ComboBox. Ce dernier étant un contrôle défilable ça m'étonnerait fort qu'il n'ait pas d'évémeent MouseWheel

public void SinkWheel( Object sender, MouseEventArgs e)
{
/* Faire ce que tu as à faire ici*/
}

toolStripComboBox1.ComboBox.MouseWheel += SinkWheel;