jdom dans le projet ne suffit pas forcément. Pour que ça suffise, il faut que l'outil de construction de projet ajoute jdom à l'archive. Dans web-inf c'est normal de l'y mettre à priori. Que ce soit manuellement ou via l'outil de construction de projet.

Ceci dit, qu'avec une signature de méthode différente tu gardes la même erreur (relative à la signature de méthode), ça me dépasse. Au risque être un peu lourdingue, je verrais bien une fausse manip dans ton déploiement, ou lors de la recompilation de la classe ou quelque chose comme ça.